Трудовая деятельность:
- 1990-1991 — электромонтажник Строительного управления промышленно-гражданского строительства АО "НГЭС" в городе Кара-Куле
- 1995-1996 — следователь следственного отделения Октябрьского РОВД Бишкека
- 1999-2000 — преподаватель Академии МВД КР
- 2000 — ученый секретарь Академии МВД КР
- 2002-2003 — начальник контрольно-правового управления Государственного комитета КР по управлению госимуществом и привлечению прямых инвестиций
- 2003 — начальник Ош-Джалал-Абад-Баткенского территориального управления Госкомимущества КР
- 2004 — руководитель аппарата Государственного комитета по управлению государственным имуществом КР
- 2005 — кандидат в депутаты Жогорку Кенеша КР по 22-му избирательному округу Кара-Куля
- 2005-2009 — эксперт отдела оргработы и политики госуправления, отдела по делам обороны и безопасности администрации президента КР
- 2009-2010 — инспектор Службы государственного советника президента КР по вопросам обороны, безопасности и правопорядка. Руководитель аппарата Государственного комитета КР по управлению госимуществом
- 2011-2013 — заместитель секретаря Совета обороны Кыргызстана
- 2013 — директор Государственного агентства геологии и минеральных ресурсов Кыргызстана. С 29 июня 2016 года являлся главой Государственного комитета промышленности, энергетики и недропользования.
С августа по ноябрь 2017 года работал на должности вице-премьер-министра Кыргызстана, после занимал пост председателя Фонда по управлению государственным имущество, но подал в отставку в конце того же года.
В октябре 2018 года Зилалиев был условно осужден на три года по обвинению в ложном сообщении о бомбе. 8 декабря 2018 года он был задержан в Бишкеке по делу о незаконном обогащении. Через день его арестовали на два месяца и водворили в СИЗО ГКНБ.
